A Direcção Nacional de Desenvolvimento Económico Local, estrutura-se em:
1. Departamento de Ordenamento Produtivo Rural
a) Repartição de Promoção de Cadeias de Valor;
b) Repartição de Planeamento Produtivo.
2. Departamento de Finanças Rurais
3. Departamento de Novas Tecnologias
4. Departamento de Planificação e Estatísticas Rurais
a) Repartição de Estatísticas Rurais
5. Departamento de Politicas, Estudos e Projectos
6. Repartição Autónoma de Comunicação Rural e Gestão de Conhecimento
7. Repartição Autónoma de Administração e Finanças
